在创造球会模式中，基本流程与前作相同，依然是杯赛获得球员，联赛育成球员。在比赛过程中可以实时用触控笔调整阵型和使用球队技能。

新要素1：前作联赛部分只有J联赛，玩到10几年后基本拿冠军没挑战。本作中在J联赛获胜后可以转战英超、西甲、意甲三大欧洲联赛，每个联赛可以习得的球员技能以及获得球员的几率各不相同。

新要素2：新增“国家队模式”，其中又分为“日本国家队挑战”和“其他国家队挑战”。在“日本国家队挑战”中，玩家可以导入在“创造球会模式”中培养出来的强力日本选手（现役或者OB都可以），组成23人的日本国家队，从亚洲区预选赛开始一步步走向世界之巅。另外，在比赛中完成支持者的要求，还可以获得用来强化队伍的点数。而在“其他国家队挑战”，可以带领42只不同的国家队参加世界杯之旅。

新要素3：新增“热斗Wifi模式”，终于了却前作不能wifi对战的遗憾。另外还有用到DS待机擦肩而过机能，两台插有本作卡带待机的DS擦肩而过时，可以获得直接抽选“Rare球员”的珍贵抽选券。

新要素4：本作收录的球员数量约为4000人（是前作的2倍），另外一些球员除了前作就有的普通版和Rare版，还有另一种新增版本。

新要素5：新增教练要素，不同的教练拥有不同的技能、战术和特殊能力。（例如视频中一闪而过的某德国教练，拥有技能有两翼齐飞lv1、体力回复、精神回复、状态回复；拥有战术是全体战术家lv1；拥有特殊能力是固定收入上升lv1。）

新要素6：前作是全触摸操作，而本作则对应触摸和按键两种操作。