生化危机3：复仇女神

　　《生化危机3复仇女神》，日版副标题为最终逃脱。本作三上真司不再作为本作的监督(游戏监督/策划/director：根据游戏制作人的决定进行现场实际指挥的人，游戏项目大的话会有不同范围的分工)，变为了游戏的制作人(游戏制作人/producer：管理游戏制作中的所有方针，日程等整个项目，有时候也会负责游戏的宣传)。本作全新加入了大受赞赏的佣兵模式，此外还加入了紧急回避系统和弹药组合系统，前者在敌人攻击的瞬间按拔枪键可以做出回避动作，后者可以用物品组合出手枪子弹或麦林子弹。本作发售后销量轻松破百万，三上也因为他的杰出表现受命组建CAPCOM的第四开发部，并担任本部长一职。当时可谓春风正得意。

　　生化危机-代号：维罗尼卡

　　生化危机系列的大成功后，CAPCOM开始和SEGA、NITENDO发生紧密合作。SEGA的DC发布后，CAPCOM马上跟进发表了面向 DC平台的新作《生化危机-代号：维罗尼卡》，并声称仅在DC上发售。然而，这部作品却没有取得预期的成功，CAPCOM后来自食其言将该作移植到PS2 平台。为此，三上真司不得不向DC玩家道歉。

　　维罗尼卡是生化危机系列首部全3D的作品，当时曾一度被认为是系列最高。画面与情节近乎完美，是CAPCOM一款不可多得的力作，然而DC销量只有平平40万，让人不禁扼腕。

　　不思議刑事

　　这是一款侦探AVG，游戏方式有些类似于恋爱ACG，通过文字选项进行游戏流程。游戏中充斥各种恶搞吐槽，相当欢乐的一款游戏。三上是本作的制作人，没想到做事严肃认真的三上也会做这样的游戏......