完成第二话之后会进入分歧路线，它们分别是“日本路线”和“CB追跡路线”，之后第五话又出现新的“11区路线”，具体如下图结构所示，蓝色路线会影响到《魔神Z》作品的加入，红色路线是《机动战士高达00》，绿色路线则是《反叛的鲁鲁修》。