Takaratomy公司宣布，人气动漫《萌菌物语》的NDS化作品《萌菌物语DS》（もやしもんDS）将于2009年7月23日发售，售价5040日元。游戏同样发生在原作的农业大学里，玩家将通过各种任务去收集与培养那些外表可爱的菌体。

在农业大学的研究室和学生宿舍等地方都设置了激发点。随着故事的发展，在各个激发点中文字冒险部分与任务部分将交替进行。

故事全篇由8个章节构成，其中包括原作的剧情以及游戏的原创事件。登场的角色由主人公泽木直保、好友结城萤外等等都将在DS版登场。

任务部分则通过触摸屏去收集各种各样的“萌菌”，还有调节温度与湿度使萌菌们充满活力等各种搞笑环节。