石之神殿

　　坐船再次来到石之神殿，这里的魔物已经不是5年前所能相提并论的了，看来，说魔王在这里也不是空穴来风。来到祭坛处，守卫再度向NIER发起了攻击。

　　BOSS战：守卫
　　攻击方式和以前差不多，注意他身上有防护罩的时候无法伤到他，先把周围的魔物都灭光才行，几次ATTACK GAGE后便能击倒。
　　在和守卫的战斗中，KAINE不幸被其武器刺穿了胸膛，身上的黑色文字慢慢浮现出来，眼看就要暴走，她让NIER和艾米尔两人别管她，快离开。但是，身为同伴，NIER他们又怎么会丢下她一个人呢...

　　BOSS战：KAINE
　　动作迅捷，还会爬墙，在墙上可以用黑之枪打下来，然后猛砍，一定HP后就自动剧情了。
　　KAINE终于恢复了清醒。"KAINE小姐，不管多少次，不管多少次，我们都会帮你恢复理智，所以，请不要再说什么丢下你，我们是同伴啊!"艾米尔又急又气，意外的可爱呢...不过这一切，都是出于对KAINE的关心。来到祭坛处，NIER得到 了迷之碎片，但是不知道到底有什么用，群众纷纷表示这种时候只要找POPOL就可以了...

　　村子
　　回到村中，POPOL告诉NIER，要收集全部的5块碎片，才能开启通往魔王城之路，而现在知道的，只有机器人山和神话之森，另外两片还需要慢慢研究。

　　机器人山
　　来到机器人山，发现只剩下弟弟一个人在这里，当被问及哥哥的下落时，弟弟的头立刻垂了下来，原来，哥哥为了救他，而被铁板压死了。NIER也明白，在这个动荡的世界，生死早已见怪不怪了，更何况，他们做着如此危险的工作呢。强化完武器后，弟弟请求NIER帮忙去杀死山中那个和机器人在一起魔物。由于多年来受到他们兄弟两的关照，NIER也不便推辞。
　　来到山中最深处，机器人P33赫然出现在众人面前，而它头顶上，有一只魔物，仿佛是在操纵着他一般，身经百战的NIER表示问题不大，顺利击破了机器人。弟弟也算是报了一箭之仇。而NIER也得到了机械碎片。

　　BOSS战：P33
　　半血之前和一般的杂鱼机器人没区别，就会踩地冲击波和魔蛋，到了半血后，他会有一招飞天攻击，只要一直跑动就不难躲避，打掉机器人后虐魔物，魔物很菜......

　　神话之森
　　村长告诉众人，神木那边有异样，让NIER过去看看。于是一番试炼再度开始了...顺利通过后得到记忆之树碎片。

　　村子
　　顺利得到两块碎片，一时没有了头绪，NIER想先回村里看看POPOL的研究是否有成果。路过邮箱时，发现假面之王发来了请帖，邀请他们去参加婚礼。那个小男孩，也到了结婚的年龄了么，NIER你感觉如何了吖?来到久违的假面之街，王的助手告诉NIER，王的结婚对象正是FYRA，也就是当年给他们带路的那个小女孩。缘分妙不可言。

　　假面之街
　　第二天，大家兴高采烈的举行了婚礼，花瓣，欢笑，充满了整条假面之街，王也带着他的妻子出现在了众人面前，但是正当他们要举行仪式之时(接吻)，一只与众不同的黑狼突然窜出，并咬住了FYRA，甩在了墙壁上。"是魔物!"NIER等人立刻迎击。

　　BOSS战：狼
　　速度很快，建议先解决掉小狼，要注意的是他有一招放出许多的风刃，全吃的话很容易就会死，由于速度快，建议用魔法蓄力时候的减速效果来应付他，HP一半之后它会撤退。
　　第二天，假面之王执意要去狼的巢穴，而助手，带着一群士兵，再一次档在了他的面前。"我想王你应该知道你自己的身份，是这条街的王...但是，在那之前，你更是一个深爱着王妃的好丈夫!"说完，他转过了头大声说道"我们的王，是谁!"士兵们异口同声的回到"是假面之王!是假面之王!""我们的王妃是谁!""是FYRA!是FYRA!""是谁杀死了我们的王妃!""是该死的狼!是该死的狼!""那么，我们应该怎么做!""手刃它们!为王妃报酬!手刃它们!为王妃报酬!"假面之王此刻的心情，实在是无以言表。没有什么，能比得到国民的理解，更令人高兴了，但是此刻，更重要的，却是为他的妻子报仇雪恨。
　　来到了沙漠深处，终于找到了那只黑狼。大家都像打了鸡血一样，冲了上去。面对士气高昂的假面部队，黑狼还是败下了阵来，被王用长矛刺穿了整个身体。而NIER，也得到了忠诚之地狱犬碎片。

　　村子
　　回到图书馆中，POPOL告诉NIER，崖之村那边开始了商卖活动，这对于那个死气沉沉的村子来说简直是不可思议的，因此NIER决定过去看看，说不定能有什么碎片的线索。

　　崖之村
　　来到村长那里，他却表示毫不知情，让他自己去集市那里看看。NIER立刻发现那里的人十分诡异，俨然是被魔物附身了，清理掉一些杂鱼之后，一个眼球状的巨大魔物赫然出现。

　　BOSS战：眼球魔物
　　攻击主要靠魔弹，当它靠近平台边缘的时候可以用剑上去砍，建议片手剑，不然容易被打断，之后剧情，要绕到它的背后用魔弹或者远距离魔法攻击，注意绕的时候要绕到较高的上方，下面是没用的，最后阶段就轻松了，直接魔弹解决。
　　魔物实在过于巨大，NIER的力量显然无法消灭它。此时，艾米尔终于使出了他真正的力量，但是，由于威力过于强大，使得整个村子都被毁灭了，这就是最终兵器的威力么?看到村子因为自己的关系被毁灭，艾米尔沮丧不已，认为这一切都是自己的错。"这是没有办法的事情。记住，不管发生什么事情，我们都会在你身边"。艾米尔因为这一番话，稍微恢复了一点元气。NIER他们也得到了最后的祭品之碎片。

　　村子
　　终于凑齐了5块碎片，接下来，要做的就是冲向魔王城，夺回自己的妹妹，NIER暗自下定了决心。